После окончания химического факультета Рязанского пединститута работал преподавателем химии в Мало-Ярославском техникуме. Закончил аспирантуру Воронежского государственного университета. В 1937 году ему была присвоена ученая степень кандидата химических наук, в 1938 году - ученое звание доцента, в 1963 году - звание профессора.
С декабря 1940 года трудился в Архангельском государственном лесотехническом институте. Прошел путь от заведующего кафедрой, потом – проректора по науке и – до ректора, в должности которого проработал 13 лет, с 1966 по 1979 годах.
Научная деятельность Ивана Михайловича была направлена на решение актуальных проблем использования природных ресурсов Севера и совершенствование технологии переработки древесины. Он опубликовал более 200 научных работ, посвященных изучению коррозии сплавов металлов в агрессивных средах и подбору ингибиторов из продуктов химической переработки древесины, исследованию межмолекулярных взаимодействий между веществами, получаемыми из древесины. В ходе данных исследований было открыто более 100 новых комплексных соединений в жидкой и твердой фазах, методами физико-химического анализа установлен их состав.
Иван Боховкин принимал активное участие в общественной жизни города и области: он являлся депутатом областного Совета депутатов трудящихся Архангельской области, председателем правления областного общества «Знание», председателем областного совета ректоров вузов.
19 ноября 1974 года, решением Архангельского горисполкома профессор Боховкин удостоен звания «Почётный гражданин Архангельска».
Иван Михайлович Боховкин скончался 6 февраля 1979 года. Похоронен на Соломбальском кладбище Архангельска. На здании АГТУ (бывшего АЛТИ) в память о нём была установлена мемориальная доска.